J-Flashプロジェクトを保存：

プロジェクト設定ダイアログが開いている場合は、「OK」ボタンをクリックしてプロジェクト設定を保存してダイアログを閉じます。

「File」→「Save project」又は「Save project as..」メニューコマンドでプロジェクトを保存します。

J-Flashプロジェクトは（*.jflash）ファイルとして保存されます。

J-Flashツールからプロジェクトを開くときには、「File」→「Open project」メニューコマンドで「.jflash」プロジェクトファイルを開きます。

ちなみに、「.jflash」プロジェクトファイルをテキストエディタから開いて設定内容の確認は可能です。