複数のJ-Link / Flasher本体をパソコンに接続し、本体のシリアル番号を指定して複数J-Flashプロジェクトを同時に実行できます。

複数のFlasher / J-Link本体をパソコンに接続するための基本準備として、「USB SN」項目にFlasher本体のシリアル番号を指定し、各ターゲット及びFlasher本体用J-Flashプロジェクトを1対1に設定します。LANポートインターフェースの場合はUSB SN ではなくFlasher本体のIPアドレスを設定します。

パソコンから複数コマンドラインコンソールからプロジェクト指定でJ-Flashツールを実行してフラッシュ書き込みを行います。
J-Flashのコマンドラインインターフェースの詳細は以下URLのサポート情報をご参照ください。